Mózg również wymaga kanabinoidów, które regulują większość głównych funkcji organizmu, w tym czujność, emocje, stany zapalne i obronę przeciwnowotworową. Mózg może wytworzyć małą liczbę własnych kanabinoidów, ale 4000 lat historii i dziesięcioleci badań naukowych wskazały, że działa optymalnie, gdy ma zapewnione dostarczenie kannabinoidów z diety.
Mózg może składać się z nasyconych i jednonienasyconych tłuszczów, ale wykazuje preferencję dla kwasów tłuszczowych Omega 3 i 6. Badania na ludziach i zwierzętach sugerują, że optymalną dla zdrowia mózgu jest sytuacja, gdy kwas linolowy (LA) i kwas a-linolenowy (ALA) są wykorzystywane w stosunku od 3,5: 1 do 4: 1, a ten stosunek znajdziemy naturalnie tylko u konopi.